7高等研究院令和元.10設置平成6.4移行平成15.10移行人文学研究科（博）平成19.4設置国際文化学研究科（博）平成19.4設置人間発達環境学研究科（博）平成19.4設置附属発達支援インスティテュート平成17.4設置法学研究科（博）昭和28.4設置経済学研究科（博）昭和28.4設置経営学研究科（博）昭和28.4設置理学研究科（博）平成19.4設置医学研究科（博）平成20.4改称工学研究科（博）平成19.4設置農学研究科（博）平成19.4設置附属食資源教育研究センター平成19.4農学部附属から移行海事科学研究科（博）平成19.4設置国際協力研究科（博）平成7.4設置附属練習船深江丸平成19.4海事科学部附属から移行乗船実習科平成15.10設置内海域環境教育研究センター平成15.10設置都市安全研究センター平成8.5設置分子フォトサイエンス研究センター平成13.4設置システム情報学研究科（博）平成22.4設置保健学研究科（博）平成20.4設置文化学研究科（博）昭和55.4設置、平成27.3廃止科学技術イノベーション研究科（博）平成30.4設置海洋底探査センター平成27.10設置社会システムイノベーションセンター平成28.4設置バイオシグナル総合研究センター平成28.4設置バリュースクール令和2.4設置先端融合研究環平成28.4設置数理・データサイエンスセンター平成29.12設置計算社会科学研究センター平成29.3学内措置､平成30.4設置先端バイオ工学研究センター平成30.7設置先端膜工学研究センター平成31.4設置未来医工学研究開発センター平成31.4設置計算科学教育センター平成26.4設置神戸バイオテクノロジー研究・人材育成センター平成16.4設置附属動物実験施設平成21.4医学部附属から移行附属感染症センター平成21.4医学部附属から附属医学医療国際交流センターを移行、改組附属国際海事研究センター平成21.10改組総合人間科学研究科（修）平成9.4設置､平成16.3廃止総合人間科学研究科（博）平成11.4設置、平成26.3廃止医学系研究科（博）平成11.4設置、平成30.3廃止自然科学研究科（博）昭和56.4設置、平成27.3廃止科学技術イノベーション研究科（修）平成28.4設置、令和2.3廃止自然科学系先端融合研究環平成19.4設置､平成28.3廃止重点研究部平成19.4設置､平成28.3廃止遺伝子実験センター平成13.4設置､平成28.3廃止バイオシグナル研究センター平成2.6設置､平成28.3廃止連携創造本部平成17.10設置、イノベーション支援本部（平成15.10設置）の機能も統合、平成28.10学術研究推進本部と統合し、学術研究推進機構下の組織として改組連携創造センター 平成15.10設置、平成17.9廃止大学文書史料室（国立公文書館等施設）平成22.4設置､平成30.4学長の下に置く室として改組（平成16.4改組）海事科学分館保健科学図書室医学分館総合図書館社会科学系図書館自然科学系図書館人文科学図書館国際文化学図書館人間科学図書館経済経営研究所図書館専門図書館人文・社会科学系図書館昭和59.4設置 六甲台図書館昭和55.4改称、昭和59.3廃止文学部図書館昭和55.4改称、昭和59.3廃止人文科学系図書室平成4.4改称人文科学系分室昭和59.4設置､平成4.3廃止人間科学系図書室平成4.10設置自然科学系図書館昭和59.4設置理学部図書館昭和55.4改称、昭和59.3廃止国際・教養系図書室平成4.10設置農学部図書館昭和55.4改称、昭和59.3廃止名谷分室平成9.4設置海事科学部分館平成15.10設置工学部図書館昭和55.4改称、昭和59.3廃止学術情報基盤センター平成15.4設置、平成22.6廃止アイソトープ総合センター平成8.5設置、平成16.3廃止環境管理センター平成16.4設置､平成26.3廃止留学生センター平成5.4設置、平成28.4日欧連携教育府と統合し、国際連携推進機構下の組織として改組機器分析センター平成6.6設置、平成16.3廃止附属国際海事教育研究センター平成19.4海事科学部附属から移行､平成21.9廃止情報基盤センター平成22.7設置研究基盤センター平成16.4設置環境保全推進センター平成26.4改組保健管理センター昭和45.4設置キャリアセンター平成19.6設置海洋教育研究基盤センター平成31.4設置キャンパスライフ支援センター平成27.12設置アドミッションセンター平成28.4設置男女共同参画推進室平成19.2設置、令和3.7学内共同管理・支援組織として改組安全保障輸出管理室平成23.1設置、令和3.7学内共同管理・支援組織として改組安全衛生・環境管理統括室平成24.3設置、令和3.7学内共同管理・支援組織として改組地域連携推進室平成16.4設置、令和3.7学内共同管理・支援組織として改組、令和3.9廃止、令和3.10地域連携推進本部設置
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